sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-AO-A03O	1	61735	14969490	2	1
TCGA-AO-A03O	1	14970812	15135528	2	0
TCGA-AO-A03O	1	15136508	117647907	2	1
TCGA-AO-A03O	1	117650999	119789055	1	1
TCGA-AO-A03O	1	119797139	121482979	2	1
TCGA-AO-A03O	1	144007049	232053907	4	1
TCGA-AO-A03O	1	232054078	236508436	7	1
TCGA-AO-A03O	1	236509341	240183676	4	1
TCGA-AO-A03O	1	240183786	241314607	7	1
TCGA-AO-A03O	1	241315683	249224388	4	1
TCGA-AO-A03O	2	12784	70291369	2	1
TCGA-AO-A03O	2	70298152	72861906	2	2
TCGA-AO-A03O	2	72861952	74429118	2	1
TCGA-AO-A03O	2	74429192	80574201	3	2
TCGA-AO-A03O	2	80574477	82349511	2	2
TCGA-AO-A03O	2	82351204	84004852	3	2
TCGA-AO-A03O	2	84012407	88619494	2	1
TCGA-AO-A03O	2	88619599	98319035	2	2
TCGA-AO-A03O	2	98320349	99563139	5	2
TCGA-AO-A03O	2	99564428	100719569	3	2
TCGA-AO-A03O	2	100728440	243089456	2	1
TCGA-AO-A03O	3	60345	4223269	2	1
TCGA-AO-A03O	3	4230231	4641912	11	1
TCGA-AO-A03O	3	4643555	6023897	7	1
TCGA-AO-A03O	3	6027244	7015671	8	1
TCGA-AO-A03O	3	7016902	7525020	13	1
TCGA-AO-A03O	3	7527372	9335660	2	1
TCGA-AO-A03O	3	9336503	9445368	2	0
TCGA-AO-A03O	3	9448085	12747690	2	1
TCGA-AO-A03O	3	12749130	13202878	13	1
TCGA-AO-A03O	3	13203543	13499969	10	1
TCGA-AO-A03O	3	13501254	14567666	6	1
TCGA-AO-A03O	3	14567685	14614244	5	1
TCGA-AO-A03O	3	14614380	53397481	2	1
TCGA-AO-A03O	3	53399112	83071715	1	1
TCGA-AO-A03O	3	83074685	85269231	6	1
TCGA-AO-A03O	3	85271940	85582680	10	1
TCGA-AO-A03O	3	85584213	86677210	2	1
TCGA-AO-A03O	3	86677278	87264496	3	2
TCGA-AO-A03O	3	87265339	93536056	3	1
TCGA-AO-A03O	3	93540792	95088613	2	2
TCGA-AO-A03O	3	95094421	103010584	3	2
TCGA-AO-A03O	3	103010857	119560606	2	2
TCGA-AO-A03O	3	119565783	120039375	2	1
TCGA-AO-A03O	3	120044792	160820401	2	2
TCGA-AO-A03O	3	160826404	161123746	2	1
TCGA-AO-A03O	3	161126180	197896118	2	2
TCGA-AO-A03O	4	12281	33186163	2	1
TCGA-AO-A03O	4	33189004	33574125	6	3
TCGA-AO-A03O	4	33576564	33699210	10	4
TCGA-AO-A03O	4	33717623	36631155	5	2
TCGA-AO-A03O	4	36631310	36843709	9	2
TCGA-AO-A03O	4	36844260	59269177	2	2
TCGA-AO-A03O	4	59269718	59846674	9	2
TCGA-AO-A03O	4	59849018	61279509	2	2
TCGA-AO-A03O	4	61286172	61774659	3	2
TCGA-AO-A03O	4	61775645	62409155	3	1
TCGA-AO-A03O	4	62413067	63446998	4	3
TCGA-AO-A03O	4	63447050	66567198	3	2
TCGA-AO-A03O	4	66568768	67336709	3	3
TCGA-AO-A03O	4	67337097	68582220	3	1
TCGA-AO-A03O	4	68582771	70132370	3	0
TCGA-AO-A03O	4	70134680	73415905	3	1
TCGA-AO-A03O	4	73415918	73974725	5	4
TCGA-AO-A03O	4	73976455	75717601	8	3
TCGA-AO-A03O	4	75717660	77553854	6	3
TCGA-AO-A03O	4	77557656	78161506	3	3
TCGA-AO-A03O	4	78161843	78858350	3	2
TCGA-AO-A03O	4	78858515	80075057	3	0
TCGA-AO-A03O	4	80080350	83039461	4	3
TCGA-AO-A03O	4	83040175	134810573	3	0
TCGA-AO-A03O	4	134811538	137319823	3	1
TCGA-AO-A03O	4	137319974	137654966	3	0
TCGA-AO-A03O	4	137658772	137808958	3	1
TCGA-AO-A03O	4	137811172	142223041	3	0
TCGA-AO-A03O	4	142230739	142723797	3	1
TCGA-AO-A03O	4	142723893	148268104	3	0
TCGA-AO-A03O	4	148275490	148635961	3	1
TCGA-AO-A03O	4	148641465	151015723	3	0
TCGA-AO-A03O	4	151016850	151817160	2	0
TCGA-AO-A03O	4	151817352	153883458	3	0
TCGA-AO-A03O	4	153886104	154825268	5	0
TCGA-AO-A03O	4	154827974	156585466	6	0
TCGA-AO-A03O	4	156594088	180243026	3	0
TCGA-AO-A03O	4	180245336	185999543	4	0
TCGA-AO-A03O	4	185999587	187997297	6	0
TCGA-AO-A03O	4	188000653	191027923	3	0
TCGA-AO-A03O	5	15532	7441829	2	2
TCGA-AO-A03O	5	7442910	12333743	2	1
TCGA-AO-A03O	5	12337292	14518891	5	2
TCGA-AO-A03O	5	14522975	16434339	3	2
TCGA-AO-A03O	5	16434558	16805287	4	4
TCGA-AO-A03O	5	16805703	18665096	10	3
TCGA-AO-A03O	5	18666822	19292659	7	3
TCGA-AO-A03O	5	19295008	23704887	3	1
TCGA-AO-A03O	5	23705948	27967034	2	1
TCGA-AO-A03O	5	27967386	28059917	3	1
TCGA-AO-A03O	5	28067086	29616784	5	2
TCGA-AO-A03O	5	29618031	32153093	2	2
TCGA-AO-A03O	5	32155553	37583086	2	1
TCGA-AO-A03O	5	37583208	44890193	3	1
TCGA-AO-A03O	5	44891470	50794466	2	1
TCGA-AO-A03O	5	50795032	52791712	2	2
TCGA-AO-A03O	5	52797719	129522950	2	1
TCGA-AO-A03O	5	129524245	180790320	3	1
TCGA-AO-A03O	6	149661	55443113	2	1
TCGA-AO-A03O	6	55444100	66409416	3	1
TCGA-AO-A03O	6	66413823	67978037	4	2
TCGA-AO-A03O	6	67978618	70548624	4	1
TCGA-AO-A03O	6	70548710	91531952	3	1
TCGA-AO-A03O	6	91537437	92593238	4	3
TCGA-AO-A03O	6	92594051	101304678	3	1
TCGA-AO-A03O	6	101304966	101548467	4	3
TCGA-AO-A03O	6	101559538	102106237	7	3
TCGA-AO-A03O	6	102112525	103367131	4	3
TCGA-AO-A03O	6	103371222	104724890	3	1
TCGA-AO-A03O	6	104725648	105449718	3	3
TCGA-AO-A03O	6	105454778	106627910	11	3
TCGA-AO-A03O	6	106631460	107791661	19	2
TCGA-AO-A03O	6	107796067	108148647	3	1
TCGA-AO-A03O	6	108149497	108791307	3	3
TCGA-AO-A03O	6	108792544	117518393	3	1
TCGA-AO-A03O	6	117521371	118271785	3	3
TCGA-AO-A03O	6	118274776	119424237	5	4
TCGA-AO-A03O	6	119425903	120033224	15	3
TCGA-AO-A03O	6	120033670	171051005	3	1
TCGA-AO-A03O	7	43259	57155720	2	1
TCGA-AO-A03O	7	57155738	61840535	2	0
TCGA-AO-A03O	7	61841806	65927613	5	2
TCGA-AO-A03O	7	65930368	77349931	2	0
TCGA-AO-A03O	7	77351705	77461218	9	2
TCGA-AO-A03O	7	77463395	125971455	2	0
TCGA-AO-A03O	7	125975678	159127004	2	1
TCGA-AO-A03O	8	31254	1586567	2	0
TCGA-AO-A03O	8	1586635	28901736	1	0
TCGA-AO-A03O	8	28904052	31475273	2	0
TCGA-AO-A03O	8	31477396	32347230	1	0
TCGA-AO-A03O	8	32347247	32873148	3	0
TCGA-AO-A03O	8	32875127	36262679	3	3
TCGA-AO-A03O	8	36263125	36642506	2	0
TCGA-AO-A03O	8	36650302	37674865	3	2
TCGA-AO-A03O	8	37675667	40630055	2	0
TCGA-AO-A03O	8	40632538	46912027	5	0
TCGA-AO-A03O	8	46912314	47584704	1	0
TCGA-AO-A03O	8	47588315	50785387	2	1
TCGA-AO-A03O	8	50785526	51911224	2	2
TCGA-AO-A03O	8	51911925	52969950	3	2
TCGA-AO-A03O	8	52970433	57743387	3	3
TCGA-AO-A03O	8	57744081	59101260	3	2
TCGA-AO-A03O	8	59102996	59645931	6	3
TCGA-AO-A03O	8	59645932	60291761	4	4
TCGA-AO-A03O	8	60292576	63313472	7	3
TCGA-AO-A03O	8	63314091	66958287	4	3
TCGA-AO-A03O	8	66962955	67321131	9	3
TCGA-AO-A03O	8	67321311	69865178	4	3
TCGA-AO-A03O	8	69867873	72622208	6	3
TCGA-AO-A03O	8	72630058	78173508	4	4
TCGA-AO-A03O	8	78174046	79198120	7	3
TCGA-AO-A03O	8	79198642	86251441	4	4
TCGA-AO-A03O	8	86253920	88271254	11	3
TCGA-AO-A03O	8	88275949	90905598	4	4
TCGA-AO-A03O	8	90917910	96656005	7	3
TCGA-AO-A03O	8	96656036	101167695	9	3
TCGA-AO-A03O	8	101174089	102965949	10	3
TCGA-AO-A03O	8	102966148	110394806	9	3
TCGA-AO-A03O	8	110395027	115754591	11	3
TCGA-AO-A03O	8	115756344	117460471	13	3
TCGA-AO-A03O	8	117460594	118771110	16	3
TCGA-AO-A03O	8	118776341	119085207	8	3
TCGA-AO-A03O	8	119091168	119576978	20	2
TCGA-AO-A03O	8	119577329	129598701	9	3
TCGA-AO-A03O	8	129598782	136421680	7	3
TCGA-AO-A03O	8	136427999	146298155	8	3
TCGA-AO-A03O	9	46587	3371746	2	0
TCGA-AO-A03O	9	3371790	5134065	2	1
TCGA-AO-A03O	9	5134627	15241496	2	0
TCGA-AO-A03O	9	15242896	15439151	1	0
TCGA-AO-A03O	9	15445219	19054862	2	0
TCGA-AO-A03O	9	19055965	22672074	2	1
TCGA-AO-A03O	9	22673694	27382085	3	2
TCGA-AO-A03O	9	27382244	47217176	2	2
TCGA-AO-A03O	9	65616971	123001258	2	0
TCGA-AO-A03O	9	123001627	123038076	2	1
TCGA-AO-A03O	9	123045195	123615523	4	2
TCGA-AO-A03O	9	123626533	123641168	1	0
TCGA-AO-A03O	9	123643319	124822049	2	0
TCGA-AO-A03O	9	124825587	131537855	3	2
TCGA-AO-A03O	9	131540224	141091394	2	0
TCGA-AO-A03O	10	72759	22665467	3	1
TCGA-AO-A03O	10	22666657	70927974	3	2
TCGA-AO-A03O	10	70931474	82965464	2	2
TCGA-AO-A03O	10	82965745	83686449	4	2
TCGA-AO-A03O	10	83686558	91514580	2	2
TCGA-AO-A03O	10	91514747	92626148	3	2
TCGA-AO-A03O	10	92629923	92852753	6	2
TCGA-AO-A03O	10	92859372	93168536	10	2
TCGA-AO-A03O	10	93174498	98619863	2	2
TCGA-AO-A03O	10	98620605	99075626	4	2
TCGA-AO-A03O	10	99078577	101066440	2	2
TCGA-AO-A03O	10	101070196	101766106	3	2
TCGA-AO-A03O	10	101766998	102155673	4	2
TCGA-AO-A03O	10	102159075	103996576	2	2
TCGA-AO-A03O	10	103998671	106227833	4	2
TCGA-AO-A03O	10	106233439	106584753	3	2
TCGA-AO-A03O	10	106585828	107261606	6	2
TCGA-AO-A03O	10	107263570	107633926	5	2
TCGA-AO-A03O	10	107640531	108428264	3	2
TCGA-AO-A03O	10	108432376	122446453	2	2
TCGA-AO-A03O	10	122449241	123081449	10	2
TCGA-AO-A03O	10	123082354	124145544	2	2
TCGA-AO-A03O	10	124145712	124564793	7	2
TCGA-AO-A03O	10	124565743	130333949	2	2
TCGA-AO-A03O	10	130334393	131583538	3	2
TCGA-AO-A03O	10	131583553	132248696	4	2
TCGA-AO-A03O	10	132250666	134761172	3	2
TCGA-AO-A03O	10	134761961	135506704	2	2
TCGA-AO-A03O	11	198572	54857922	2	1
TCGA-AO-A03O	11	54858308	62462449	1	1
TCGA-AO-A03O	11	62464361	68306678	2	1
TCGA-AO-A03O	11	68308350	68947705	8	1
TCGA-AO-A03O	11	68955847	69966482	13	1
TCGA-AO-A03O	11	69970637	71353265	16	0
TCGA-AO-A03O	11	71353341	81800842	1	1
TCGA-AO-A03O	11	81804389	83931056	1	0
TCGA-AO-A03O	11	83931881	86483040	2	1
TCGA-AO-A03O	11	86490580	88048875	3	1
TCGA-AO-A03O	11	88052589	89946909	4	1
TCGA-AO-A03O	11	89948122	91219010	1	1
TCGA-AO-A03O	11	91228484	115584782	1	0
TCGA-AO-A03O	11	115585421	117031564	3	0
TCGA-AO-A03O	11	117034729	119883753	2	0
TCGA-AO-A03O	11	119886078	127112517	1	0
TCGA-AO-A03O	11	127118281	127948238	2	0
TCGA-AO-A03O	11	127948740	134944770	1	0
TCGA-AO-A03O	12	150442	4851380	3	2
TCGA-AO-A03O	12	4852512	37880478	2	0
TCGA-AO-A03O	12	37888238	45353188	2	1
TCGA-AO-A03O	12	45356669	45524511	3	2
TCGA-AO-A03O	12	45524786	47290149	6	2
TCGA-AO-A03O	12	47290652	48003617	4	2
TCGA-AO-A03O	12	48004737	48670864	2	1
TCGA-AO-A03O	12	48672306	49072071	4	2
TCGA-AO-A03O	12	49072090	54995768	2	1
TCGA-AO-A03O	12	54995816	57260027	3	2
TCGA-AO-A03O	12	57260192	57968918	5	2
TCGA-AO-A03O	12	57969671	58010163	6	2
TCGA-AO-A03O	12	58018979	58966670	10	2
TCGA-AO-A03O	12	58969236	60167884	5	2
TCGA-AO-A03O	12	60169899	60876090	10	1
TCGA-AO-A03O	12	60876219	61936744	6	2
TCGA-AO-A03O	12	61936838	62934442	3	2
TCGA-AO-A03O	12	62936230	62947550	7	0
TCGA-AO-A03O	12	62950556	64664617	9	2
TCGA-AO-A03O	12	64664857	64988154	4	2
TCGA-AO-A03O	12	64990375	67129138	2	2
TCGA-AO-A03O	12	67130634	67423067	5	2
TCGA-AO-A03O	12	67424074	68246615	7	2
TCGA-AO-A03O	12	68246876	68662461	2	2
TCGA-AO-A03O	12	68662611	69265598	2	1
TCGA-AO-A03O	12	69268578	70024278	30	1
TCGA-AO-A03O	12	70024526	70843426	5	2
TCGA-AO-A03O	12	70848574	72058416	3	2
TCGA-AO-A03O	12	72060394	72670671	5	2
TCGA-AO-A03O	12	72670725	73194124	4	2
TCGA-AO-A03O	12	73194166	74607163	7	2
TCGA-AO-A03O	12	74622184	77166137	2	1
TCGA-AO-A03O	12	77169391	77816972	7	2
TCGA-AO-A03O	12	77817357	78078890	4	2
TCGA-AO-A03O	12	78080947	98790334	2	1
TCGA-AO-A03O	12	98790879	99038024	1	1
TCGA-AO-A03O	12	99043439	133778189	2	1
TCGA-AO-A03O	13	19026949	26806641	1	0
TCGA-AO-A03O	13	26810678	27916240	3	0
TCGA-AO-A03O	13	27917606	28942222	1	0
TCGA-AO-A03O	13	28944736	31138846	3	0
TCGA-AO-A03O	13	31139890	36519446	1	0
TCGA-AO-A03O	13	36520735	47409034	3	0
TCGA-AO-A03O	13	47410103	89197260	2	0
TCGA-AO-A03O	13	89204258	89335094	1	0
TCGA-AO-A03O	13	89337009	115108397	2	0
TCGA-AO-A03O	14	19002124	23532985	2	2
TCGA-AO-A03O	14	23534166	24414297	3	2
TCGA-AO-A03O	14	24414312	25572534	2	2
TCGA-AO-A03O	14	25572989	27041209	12	2
TCGA-AO-A03O	14	27041892	32913223	31	1
TCGA-AO-A03O	14	32915225	51508125	2	2
TCGA-AO-A03O	14	51512813	52409630	2	1
TCGA-AO-A03O	14	52410025	69422865	2	2
TCGA-AO-A03O	14	69423164	74083679	4	2
TCGA-AO-A03O	14	74083837	84467550	2	2
TCGA-AO-A03O	14	84467962	87231754	2	1
TCGA-AO-A03O	14	87232503	107285437	2	2
TCGA-AO-A03O	15	20016328	102469040	2	1
TCGA-AO-A03O	16	60777	23854734	3	2
TCGA-AO-A03O	16	23859734	27788873	2	2
TCGA-AO-A03O	16	27789171	27815972	5	2
TCGA-AO-A03O	16	27819251	34360980	2	2
TCGA-AO-A03O	16	34361393	34449700	1	1
TCGA-AO-A03O	16	34459037	35283226	3	2
TCGA-AO-A03O	16	46463782	47237485	2	2
TCGA-AO-A03O	16	47238176	48396338	6	2
TCGA-AO-A03O	16	48401916	48983776	4	2
TCGA-AO-A03O	16	48984243	49750790	2	2
TCGA-AO-A03O	16	49754585	50745199	2	0
TCGA-AO-A03O	16	50745583	52865676	3	3
TCGA-AO-A03O	16	52870154	55165935	2	0
TCGA-AO-A03O	16	55169145	57962062	3	2
TCGA-AO-A03O	16	57967192	70749970	2	0
TCGA-AO-A03O	16	70749997	71202489	3	0
TCGA-AO-A03O	16	71202797	90287535	2	0
TCGA-AO-A03O	17	526	27827368	3	0
TCGA-AO-A03O	17	27831800	28425752	4	1
TCGA-AO-A03O	17	28428239	62095117	3	0
TCGA-AO-A03O	17	62095939	62721615	3	1
TCGA-AO-A03O	17	62725837	80144472	3	0
TCGA-AO-A03O	17	80148270	81049726	3	1
TCGA-AO-A03O	18	48133	10371745	2	0
TCGA-AO-A03O	18	10373765	11598990	3	2
TCGA-AO-A03O	18	11602053	12210088	2	2
TCGA-AO-A03O	18	12210447	28076699	2	1
TCGA-AO-A03O	18	28086534	29136224	11	1
TCGA-AO-A03O	18	29136463	30606621	16	0
TCGA-AO-A03O	18	30614186	31554181	4	1
TCGA-AO-A03O	18	31557113	62408138	2	1
TCGA-AO-A03O	18	62418444	72872096	1	1
TCGA-AO-A03O	18	72874291	78015057	2	1
TCGA-AO-A03O	19	90910	13532504	3	0
TCGA-AO-A03O	19	13534676	13614007	5	2
TCGA-AO-A03O	19	13622333	27780956	3	0
TCGA-AO-A03O	19	27781291	38079297	3	3
TCGA-AO-A03O	19	38079391	41066461	4	2
TCGA-AO-A03O	19	41068931	45536190	2	1
TCGA-AO-A03O	19	45543787	59097854	3	1
TCGA-AO-A03O	20	61305	8926567	3	0
TCGA-AO-A03O	20	8926960	9316762	2	0
TCGA-AO-A03O	20	9317266	30428850	3	0
TCGA-AO-A03O	20	30429904	36685697	3	1
TCGA-AO-A03O	20	36685751	36750769	6	3
TCGA-AO-A03O	20	36753874	38311369	7	3
TCGA-AO-A03O	20	38312216	38985258	12	3
TCGA-AO-A03O	20	38985986	40295461	5	3
TCGA-AO-A03O	20	40296287	41790985	4	3
TCGA-AO-A03O	20	41791170	46191393	3	2
TCGA-AO-A03O	20	46194411	47999162	3	3
TCGA-AO-A03O	20	48008281	48545111	6	3
TCGA-AO-A03O	20	48545610	48939076	4	3
TCGA-AO-A03O	20	48939839	50916922	3	1
TCGA-AO-A03O	20	50920041	53614948	7	1
TCGA-AO-A03O	20	53615397	53877446	3	1
TCGA-AO-A03O	20	53881828	54097066	6	1
TCGA-AO-A03O	20	54101600	54933135	6	3
TCGA-AO-A03O	20	54933446	55026741	11	6
TCGA-AO-A03O	20	55029388	55545968	5	5
TCGA-AO-A03O	20	55546323	56103756	8	5
TCGA-AO-A03O	20	56104992	57351629	5	3
TCGA-AO-A03O	20	57351704	62956153	3	3
TCGA-AO-A03O	21	10736871	17057220	3	0
TCGA-AO-A03O	21	17058713	22134100	4	0
TCGA-AO-A03O	21	22139460	23893309	3	0
TCGA-AO-A03O	21	23899602	29051835	4	0
TCGA-AO-A03O	21	29057728	34147901	3	0
TCGA-AO-A03O	21	34152827	40891691	4	0
TCGA-AO-A03O	21	40891862	42277945	3	0
TCGA-AO-A03O	21	42279866	44609861	4	0
TCGA-AO-A03O	21	44609882	47711692	4	1
TCGA-AO-A03O	21	47719127	48096957	4	0
TCGA-AO-A03O	22	16052528	28941071	3	2
TCGA-AO-A03O	22	28942887	33906161	3	1
TCGA-AO-A03O	22	33906177	51234455	2	1
TCGA-AO-A03O	X	168477	4201926	2	1
TCGA-AO-A03O	X	4203054	26424277	2	2
TCGA-AO-A03O	X	26429860	27179584	2	1
TCGA-AO-A03O	X	27185677	155233846	2	2
